Écrivez-nous et dites-nous en quoi consiste votre projet de recherche. Nous voulons comprendre vos objectifs et explorer comment CARTaGENE peut contribuer à vos découvertes.
Publications
2026/08/22
Accédez rapidement à la richesse des données de CARTaGENE
Une ressource unique pour la recherche en santé
CARTaGENE est une cohorte longitudinale et une plateforme publique de recherche de Santé Québec – CHU Sainte-Justine qui vise à accélérer les découvertes en santé. Elle regroupe des échantillons biologiques et des données détaillées sur la santé et les habitudes de vie de 43 000 Québécoises et Québécois âgés de 40 à 69 ans au moment du recrutement.
Grâce à un consentement large, ces données et échantillons peuvent être utilisés par des équipes issues des secteurs public et privé pour des projets de recherche en santé. La plateforme offre plus de 13 000 variables avec un suivi longitudinal, incluant des mesures physiques, des données environnementales et nutritionnelles, des IRM, des données biochimiques et des informations génétiques.
Ces données sont jumelées aux données médico-administratives depuis 1998 (hospitalisations, diagnostics, médicaments, décès, registres de cancer, etc.). Des reconstructions généalogiques sont également disponibles pour les participants ayant contribué au projet BALSAC. CARTaGENE fait partie du consortium pancanadien CanPath, qui harmonise des données sur 300 000 personnes à travers le pays.
Actualités et ressources récentes
Publications
2026/08/19
Serum concentrations of legacy, alternative, and precursor per- and polyfluoroalkyl substances: a descriptive analysis of premenopausal participants in the Canadian CARTaGENE cohort
Publications
2026/07/25
Cardiovascular risk is increased in patients with Paget's disease of bone: Insights from the CARTaGENE cohort
Explorez nos données
Données des questionnaires
Des données riches sur la santé au recrutement et aux suivis : nutrition, environnement de vie et de travail, exposition à la COVID-19, et bien plus.
Données jumelées
Des données jumelées à partir de bases de données administratives sur la santé (MED-ECHO, Registre du cancer), l’environnement (CANUE) et une base de données généalogique (BALSAC).
Mesures physiques et cognitives
Des données précises sur la condition physique et cognitive : mesures anthropométriques, pression artérielle, densité osseuse, ainsi que tests de mémoire, raisonnement et temps de réaction.
Données biochimiques et hématologiques
Des données clés issues d’analyses sanguines : hémogramme, glycémie, profil lipidique, électrolytes, ainsi que les fonctions rénale, hépatique et thyroïdienne.
Données génétiques
Des données de génotypage pangénomique (dont imputation) et des données de séquençage (génomes entiers, ARN, exomes).
Échantillons biologiques
Dérivés du sang (sang complet, plasma, sérum), ADN, urine.
Une demande d’accès en trois étapes simples
-
1
Créez votre compte et déposez votre demande
-
2
Évaluation par le comité d’accès de CARTaGENE
-
3
Après approbation, signez le contrat d'accès
Des questions? Parlons-en!
Notre équipe d’accès est là pour vous accompagner.
Explorez nos projets par thématique
Découvrez la diversité des projets de recherche réalisés avec les données de CARTaGENE
Initiatives en cours
Collecte
2025/05/20
Suivi de santé
Le suivi de santé de CARTaGENE vise à mettre à jour les informations de participantes et participants et à enrichir les données sur leur santé et leurs habitudes de vie, afin de soutenir la recherche…
Données et outils
2025/04/01
Séquençage de génomes 2025
Collecte
2024/06/10
NutriQuébec
Données et outils
2020/01/01
CANUE
Accès et projets
Non, les chercheuses et chercheurs internationaux peuvent aussi avoir accès aux données de CARTaGENE.
Toutes les étapes sont décrites sur notre portail. Vous devrez avoir un protocole de recherche, l’approbation éthique institutionnelle de ce protocole, votre CV et une preuve de fonds (surtout pour l’accès aux échantillons).
La chercheuse ou le chercheur principal doit être la personne ayant des privilèges de recherche dans l’institution (chercheuse ou chercheur indépendant). Ce sera elle qui signera le contrat d’accès. Les postdocs et étudiants peuvent être ajoutés comme cochercheuses ou cochercheurs dans la section collaborateurs.
Il s’agit de la personne habilitée à signer les ententes au nom de l’institution. Il faut vous adresser au bureau des contrats ou au bureau des affaires légales, ils pourront vous renseigner.
Les exemptions ne sont pas reconnues par notre institution. Dans ce cas précis, nous allons soumettre votre projet pour évaluation par le comité d’éthique du CHU Sainte-Justine.
Bien sûr! Tous les consentements sont disponibles dans la section Documents de notre portail. On y trouve aussi d’autres documents importants, comme les questionnaires, le contrat d’accès et la Politique d’accès.
Les détails des frais d’accès se trouvent dans la section Processus d’accès de notre portail. Les frais d’accès aux données couvrent une période maximale de 5 ans.
Tout à fait! Nous vous encourageons à utiliser CARTaGENE dans tous vos projets. Plusieurs chercheuses et chercheurs ont plus d’un projet avec nous.
On ne limite pas le nombre de projets sur la même thématiques
La liste des projets approuvées est ici. Les PI sont identifiés. Vous pouvez les contacter pour une éventuelle collaboration.
Données
Oui. Nous avons un catalogue dynamique.
Les données de questionnaires sont fournies sous forme de fichiers CSV compressés. En raison de la taille importante de certains fichiers, nous recommandons l’utilisation de R pour l’analyse plutôt qu’Excel, qui est moins adapté aux grands volumes de données.
Nous utilisons la plateforme sécurisée Nextcloud pour le transfert standard des données. Lors d’un envoi, vous recevrez deux courriels distincts :
- le premier contenant un lien temporaire pour télécharger les données;
- le second contenant le mot de passe nécessaire pour y accéder.
Étant donné la taille importante des fichiers génétiques, leur transfert s’effectue plutôt via le service Globus. Un compte Globus est donc requis pour recevoir ce type de données.
Les mesures de sécurité exigées pour l’utilisation des données de CARTaGENE sont détaillées à l’annexe 2 du contrat d’accès. À titre de rappel, les exigences minimales incluent notamment :
- Aucun partage de données par courriel;
- Utilisation d’un ordinateur chiffré (crypté) et protégé par un mot de passe.
Les chercheuses et chercheurs sont responsables de s’assurer que l’ensemble des mesures décrites au contrat est respecté tout au long de la durée du projet.
Projets collaboratifs
Les données sont partagées par projet. Vous pouvez collaborer avec d’autres chercheuses et chercheurs au sein d’un même projet, mais chaque projet doit faire l’objet d’une demande d’accès distincte.
Oui, il suffit de faire des amendements pour ajout de collaborateurs.
Si elle veut collaborer avec vous sur votre projet, vous pouvez faire un amendement pour ajout de collaborateur. Si elle veut les données pour travailler sur son propre projet, elle doit soumettre une demande distincte.
Échantillons
Sang complet, sang complet pour ARN (Tubes Tempus), prélèvements de sang séché (Cartes Whatman), plasma (Tubes de collecte PST, EDTA, Na-Citrate ou Supelco), sérum (Tubes de collecte SST), Urine, ADN extrait.
Des détails sur les échantillons sanguins sont disponibles sur le portail dans la section Échantillons.
Pour certains participants (n ≈ 1 500), nous disposons d’échantillons sanguins (sang total, plasma, sérum) prélevés au moment du recrutement et à nouveau cinq ans plus tard. Nous avons également des échantillons de sang séché recueillis dans le cadre de l’étude COVID‑19. Des détails sur les échantillons sanguins sont disponibles sur le portail dans la section Échantillons.
Les échantillons sont une ressource précieuse et non renouvelable. Nous proposons donc le volume minimal requis selon la technique utilisée. À titre indicatif, nos aliquots de plasma et de sérum sont de 500 µL.
Tous les tarifs sont disponibles sur le portail dans la section Processus d’accès.
Retour de données
Le type de données à retourner dépend de la nature du projet. Il peut s’agir, par exemple :
- de résultats d’analyses réalisées à partir d’échantillons biologiques;
- de variables dérivées ou de scores calculés à partir des données de santé de CARTaGENE.
Le type de données à retourner est généralement discuté avec l’équipe interne de CARTaGENE lors de l’évaluation de la faisabilité du projet. La description précise des ensembles de données à retourner figure à l’annexe 3 du contrat d’accès.
Les données peuvent être partagées avec d’autres chercheuses et chercheurs dans le cadre de nouveaux projets.
Publications
Oui. Cette obligation correspond à la clause 4.7 du contrat d’accès : Au moins trente (30) jours avant de publier les résultats du Projet de Recherche, remettre à CARTaGENE une copie du manuscrit que la chercheuse ou le chercheur a l’intention de publier pour vérifier tout risque potentiel d’identification d’un participant.
Il faut ajouter la déclaration suivante dans la section Ackowledgements: This research has been conducted using Data/Biosamples from CARTaGENE (https://cartagene.qc.ca/en). CARTaGENE receives financial support from Genome Québec (Ministère de l’Économie, de l’Innovation et de l’Énergie), the Canadian Partnership Against Cancer and Health Canada.
Demandes de financement
Oui. Nous pouvons également fournir une estimation des frais d’accès. Idéalement, veuillez nous fournir une ébauche de lettre. Minimalement, il nous faut :
- Le nom et l’affiliation de la personne à qui adresser la lettre;
- Le titre de votre projet;
- Un résumé de votre projet;
- Le nom de la compétition et de l’organisme subventionnaire;
- La date limite de soumission de la lettre;
- Une liste des ensembles de données et/ou échantillons dont vous aurez besoin.